Šesť rokov po udalostiach z filmu Deadpool 2 (2018) žije Wade Wilson pokojným životom, pretože časy žoldniera Deadpoola nechal za sebou, až kým ho Úrad pre časové odchýlky (TVA) – byrokratická organizácia, ktorá existuje mimo času a priestoru a monitoruje časovú os – nevtiahne do novej misie. Keďže jeho domovský vesmír čelí existenčnej hrozbe, Wilson sa neochotne pridá k ešte neochotnejšiemu Wolverinovi na misii, ktorá zmení dejiny Marvel MCU.
Deadpool se snaží vyrovnat se smrtí své milované Vanessy v Deadpool 2. Cestuje v čase, aby ji zachránil, ale jeho pokus se zvrtne a způsobí katastrofu v časové linii. Aby napravil své chyby, Deadpool se spojí s Wolverinem, aby mu pomohli cestovat časem a napravit minulost.
